Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI4P10075 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI4P10075 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI4P10075 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI4P10075 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI4P10075 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI4P10075 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI4P10075 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI4P10075 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GLI4P10075 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI4P10075 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI4P10075 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLI4P10075 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI4P10075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLI4P10075 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLI4P10075 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI4P10075 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GLI4P10075 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI4P10075 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI4P10075 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI4P10075 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GLI4P10075 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GLI4P10075 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI4P10075 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GLI4P10075 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI4P10075 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GLI4P10075 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI4P10075 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GLI4P10075 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI4P10075 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI4P10075 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI4P10075 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GLI4P10075 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GLI4P10075 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI4P10075 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GLI4P10075 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GLI4P10075 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI4P10075 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GLI4P10075 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI4P10075 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GLI4P10075 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GLI4P10075 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI4P10075 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI4P10075 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI4P10075 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GLI4P10075 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI4P10075 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI4P10075 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI4P10075 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GLI4P10075 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI4P10075 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI4P10075 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI4P10075 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI4P10075 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI4P10075 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GLI4P10075 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI4P10075 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI4P10075 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI4P10075 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI4P10075 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GLI4P10075 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI4P10075 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI4P10075 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI4P10075 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI4P10075 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GLI4P10075 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GLI4P10075 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI4P10075 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI4P10075 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI4P10075 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI4P10075 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI4P10075 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI4P10075 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI4P10075 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI4P10075 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI4P10075 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI4P10075 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI4P10075 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI4P10075 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI4P10075 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI4P10075 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI4P10075 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI4P10075 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI4P10075 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GLI4P10075 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GLI4P10075 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI4P10075 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GLI4P10075 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GLI4P10075 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI4P10075 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GLI4P10075 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI4P10075 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI4P10075 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GLI4P10075 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms