Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CBSLP0DN79 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CBSLP0DN79 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CBSLP0DN79 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CBSLP0DN79 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CBSLP0DN79 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CBSLP0DN79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CBSLP0DN79 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CBSLP0DN79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CBSLP0DN79 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms