Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CSH2P0DML3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CSH2P0DML3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CSH2P0DML3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSH2P0DML3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSH2P0DML3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSH2P0DML3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSH2P0DML3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSH2P0DML3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSH2P0DML3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms