Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMIM13P0DJ93 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMIM13P0DJ93 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SMIM13P0DJ93 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMIM13P0DJ93 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM13P0DJ93 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM13P0DJ93 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM13P0DJ93 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms