Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC159P0C7I6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC159P0C7I6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC159P0C7I6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC159P0C7I6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC159P0C7I6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC159P0C7I6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC159P0C7I6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC159P0C7I6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC159P0C7I6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms