Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L7P0C7H9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
USP17L7P0C7H9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L7P0C7H9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
USP17L7P0C7H9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
USP17L7P0C7H9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP17L7P0C7H9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L7P0C7H9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L7P0C7H9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L7P0C7H9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP17L7P0C7H9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP17L7P0C7H9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
USP17L7P0C7H9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
USP17L7P0C7H9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms