Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Hoxb7P09024 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Hoxb7P09024 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hoxb7P09024 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Hoxb7P09024 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Hoxb7P09024 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Hoxb7P09024 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Hoxb7P09024 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Hoxb7P09024 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hoxb7P09024 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Hoxb7P09024 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Hoxb7P09024 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Hoxb7P09024 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Hoxb7P09024 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Hoxb7P09024 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Hoxb7P09024 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Hoxb7P09024 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Hoxb7P09024 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Hoxb7P09024 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Hoxb7P09024 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Hoxb7P09024 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hoxb7P09024 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxb7P09024 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hoxb7P09024 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Hoxb7P09024 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Hoxb7P09024 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Hoxb7P09024 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Hoxb7P09024 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxb7P09024 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxb7P09024 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxb7P09024 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Hoxb7P09024 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Hoxb7P09024 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hoxb7P09024 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Hoxb7P09024 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hoxb7P09024 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Hoxb7P09024 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hoxb7P09024 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hoxb7P09024 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hoxb7P09024 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Hoxb7P09024 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Hoxb7P09024 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Hoxb7P09024 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms