Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb6P09023 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb6P09023 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb6P09023 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb6P09023 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb6P09023 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb6P09023 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb6P09023 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb6P09023 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxb6P09023 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb6P09023 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb6P09023 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxb6P09023 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb6P09023 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb6P09023 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb6P09023 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb6P09023 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb6P09023 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb6P09023 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms