Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ApoeP08226 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ApoeP08226 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApoeP08226 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ApoeP08226 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ApoeP08226 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ApoeP08226 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ApoeP08226 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ApoeP08226 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApoeP08226 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ApoeP08226 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ApoeP08226 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApoeP08226 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ApoeP08226 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ApoeP08226 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ApoeP08226 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ApoeP08226 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms