Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI1P08151 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI1P08151 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GLI1P08151 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GLI1P08151 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI1P08151 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GLI1P08151 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI1P08151 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI1P08151 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GLI1P08151 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GLI1P08151 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI1P08151 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GLI1P08151 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GLI1P08151 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GLI1P08151 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI1P08151 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI1P08151 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GLI1P08151 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GLI1P08151 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GLI1P08151 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI1P08151 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI1P08151 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GLI1P08151 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI1P08151 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GLI1P08151 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
GLI1P08151 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GLI1P08151 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GLI1P08151 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GLI1P08151 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GLI1P08151 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI1P08151 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI1P08151 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI1P08151 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GLI1P08151 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GLI1P08151 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GLI1P08151 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI1P08151 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI1P08151 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GLI1P08151 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GLI1P08151 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI1P08151 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GLI1P08151 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
GLI1P08151 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI1P08151 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI1P08151 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GLI1P08151 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI1P08151 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GLI1P08151 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLI1P08151 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GLI1P08151 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI1P08151 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI1P08151 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI1P08151 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GLI1P08151 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GLI1P08151 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GLI1P08151 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI1P08151 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GLI1P08151 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GLI1P08151 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GLI1P08151 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI1P08151 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI1P08151 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI1P08151 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GLI1P08151 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI1P08151 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI1P08151 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI1P08151 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI1P08151 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI1P08151 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI1P08151 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI1P08151 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI1P08151 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI1P08151 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI1P08151 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI1P08151 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI1P08151 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI1P08151 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI1P08151 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GLI1P08151 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GLI1P08151 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI1P08151 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI1P08151 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GLI1P08151 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI1P08151 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GLI1P08151 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI1P08151 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI1P08151 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI1P08151 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GLI1P08151 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GLI1P08151 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI1P08151 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GLI1P08151 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GLI1P08151 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GLI1P08151 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms