Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GP1BAP07359 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GP1BAP07359 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GP1BAP07359 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GP1BAP07359 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GP1BAP07359 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GP1BAP07359 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GP1BAP07359 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GP1BAP07359 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GP1BAP07359 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GP1BAP07359 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GP1BAP07359 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GP1BAP07359 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms