Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSF1RP07333 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSF1RP07333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSF1RP07333 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSF1RP07333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSF1RP07333 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CSF1RP07333 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CSF1RP07333 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CSF1RP07333 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CSF1RP07333 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSF1RP07333 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CSF1RP07333 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSF1RP07333 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CSF1RP07333 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CSF1RP07333 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CSF1RP07333 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CSF1RP07333 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CSF1RP07333 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CSF1RP07333 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CSF1RP07333 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CSF1RP07333 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CSF1RP07333 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSF1RP07333 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSF1RP07333 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CSF1RP07333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
CSF1RP07333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CSF1RP07333 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CSF1RP07333 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CSF1RP07333 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms