Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SparcP07214 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SparcP07214 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SparcP07214 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SparcP07214 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SparcP07214 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SparcP07214 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SparcP07214 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SparcP07214 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SparcP07214 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SparcP07214 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SparcP07214 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SparcP07214 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SparcP07214 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SparcP07214 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SparcP07214 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SparcP07214 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SparcP07214 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SparcP07214 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SparcP07214 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SparcP07214 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SparcP07214 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SparcP07214 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SparcP07214 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SparcP07214 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SparcP07214 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SparcP07214 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SparcP07214 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SparcP07214 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SparcP07214 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SparcP07214 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SparcP07214 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SparcP07214 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SparcP07214 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SparcP07214 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SparcP07214 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SparcP07214 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SparcP07214 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SparcP07214 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SparcP07214 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SparcP07214 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SparcP07214 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SparcP07214 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SparcP07214 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SparcP07214 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SparcP07214 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SparcP07214 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SparcP07214 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SparcP07214 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SparcP07214 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SparcP07214 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SparcP07214 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SparcP07214 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SparcP07214 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SparcP07214 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SparcP07214 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SparcP07214 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SparcP07214 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SparcP07214 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SparcP07214 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SparcP07214 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SparcP07214 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SparcP07214 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SparcP07214 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SparcP07214 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SparcP07214 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SparcP07214 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SparcP07214 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SparcP07214 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SparcP07214 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SparcP07214 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SparcP07214 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SparcP07214 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SparcP07214 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SparcP07214 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SparcP07214 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SparcP07214 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SparcP07214 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SparcP07214 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SparcP07214 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SparcP07214 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SparcP07214 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SparcP07214 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SparcP07214 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SparcP07214 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SparcP07214 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SparcP07214 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SparcP07214 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SparcP07214 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SparcP07214 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SparcP07214 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SparcP07214 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SparcP07214 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SparcP07214 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms