Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn3P06796 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Csn3P06796 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Csn3P06796 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csn3P06796 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn3P06796 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn3P06796 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csn3P06796 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csn3P06796 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csn3P06796 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csn3P06796 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms