Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CALB1P05937 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALB1P05937 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALB1P05937 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALB1P05937 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALB1P05937 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALB1P05937 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALB1P05937 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALB1P05937 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALB1P05937 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALB1P05937 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALB1P05937 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALB1P05937 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALB1P05937 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALB1P05937 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALB1P05937 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALB1P05937 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALB1P05937 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CALB1P05937 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALB1P05937 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALB1P05937 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALB1P05937 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALB1P05937 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CALB1P05937 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALB1P05937 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALB1P05937 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALB1P05937 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALB1P05937 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALB1P05937 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALB1P05937 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALB1P05937 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CALB1P05937 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALB1P05937 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALB1P05937 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CALB1P05937 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALB1P05937 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALB1P05937 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALB1P05937 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CALB1P05937 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CALB1P05937 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALB1P05937 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CALB1P05937 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALB1P05937 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALB1P05937 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALB1P05937 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALB1P05937 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALB1P05937 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALB1P05937 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALB1P05937 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALB1P05937 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALB1P05937 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALB1P05937 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALB1P05937 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALB1P05937 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALB1P05937 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALB1P05937 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALB1P05937 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALB1P05937 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALB1P05937 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CALB1P05937 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALB1P05937 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CALB1P05937 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CALB1P05937 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALB1P05937 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALB1P05937 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CALB1P05937 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALB1P05937 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CALB1P05937 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CALB1P05937 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALB1P05937 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALB1P05937 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALB1P05937 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALB1P05937 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CALB1P05937 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CALB1P05937 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALB1P05937 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALB1P05937 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALB1P05937 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CALB1P05937 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CALB1P05937 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALB1P05937 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CALB1P05937 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALB1P05937 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALB1P05937 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CALB1P05937 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALB1P05937 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALB1P05937 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALB1P05937 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALB1P05937 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALB1P05937 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALB1P05937 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALB1P05937 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALB1P05937 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CALB1P05937 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALB1P05937 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CALB1P05937 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALB1P05937 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALB1P05937 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CALB1P05937 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CALB1P05937 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms