Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F13BP05160 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F13BP05160 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F13BP05160 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F13BP05160 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F13BP05160 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F13BP05160 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
F13BP05160 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
F13BP05160 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
F13BP05160 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
F13BP05160 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F13BP05160 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F13BP05160 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
F13BP05160 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
F13BP05160 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13BP05160 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13BP05160 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13BP05160 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13BP05160 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13BP05160 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13BP05160 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13BP05160 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13BP05160 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13BP05160 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13BP05160 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13BP05160 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
F13BP05160 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13BP05160 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13BP05160 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13BP05160 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
F13BP05160 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
F13BP05160 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13BP05160 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13BP05160 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
F13BP05160 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F13BP05160 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
F13BP05160 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13BP05160 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F13BP05160 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13BP05160 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13BP05160 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F13BP05160 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F13BP05160 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F13BP05160 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F13BP05160 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F13BP05160 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F13BP05160 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F13BP05160 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
F13BP05160 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
F13BP05160 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
F13BP05160 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F13BP05160 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
F13BP05160 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13BP05160 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
F13BP05160 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13BP05160 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
F13BP05160 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13BP05160 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
F13BP05160 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
F13BP05160 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
F13BP05160 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
F13BP05160 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
F13BP05160 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
F13BP05160 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13BP05160 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13BP05160 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13BP05160 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
F13BP05160 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13BP05160 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
F13BP05160 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F13BP05160 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F13BP05160 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
F13BP05160 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F13BP05160 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F13BP05160 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F13BP05160 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F13BP05160 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
F13BP05160 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
F13BP05160 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
F13BP05160 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F13BP05160 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
F13BP05160 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
F13BP05160 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F13BP05160 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
F13BP05160 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
F13BP05160 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24■■□□□ 1.43
F13BP05160 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F13BP05160 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
F13BP05160 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
F13BP05160 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
F13BP05160 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
F13BP05160 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F13BP05160 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F13BP05160 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F13BP05160 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
F13BP05160 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F13BP05160 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
F13BP05160 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F13BP05160 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
F13BP05160 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms