Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P04213 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P04213 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P04213 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
P04213 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P04213 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P04213 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
P04213 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P04213 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
P04213 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04213 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04213 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P04213 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P04213 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
P04213 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P04213 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P04213 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P04213 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
P04213 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P04213 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P04213 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P04213 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P04213 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
P04213 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P04213 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P04213 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P04213 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P04213 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P04213 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P04213 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P04213 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04213 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04213 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P04213 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P04213 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P04213 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P04213 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P04213 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P04213 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P04213 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04213 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P04213 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P04213 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P04213 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P04213 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
P04213 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P04213 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P04213 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P04213 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P04213 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P04213 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P04213 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P04213 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P04213 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P04213 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P04213 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P04213 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P04213 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P04213 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P04213 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P04213 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P04213 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P04213 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P04213 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P04213 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P04213 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P04213 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P04213 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P04213 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
P04213 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P04213 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P04213 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04213 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P04213 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04213 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04213 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P04213 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P04213 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P04213 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04213 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P04213 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04213 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P04213 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04213 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P04213 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04213 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04213 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P04213 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04213 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04213 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P04213 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04213 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04213 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P04213 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
P04213 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04213 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04213 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P04213 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P04213 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P04213 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms