Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HRGP04196 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRGP04196 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRGP04196 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HRGP04196 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HRGP04196 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HRGP04196 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRGP04196 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HRGP04196 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HRGP04196 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HRGP04196 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HRGP04196 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRGP04196 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HRGP04196 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRGP04196 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HRGP04196 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRGP04196 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRGP04196 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRGP04196 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRGP04196 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HRGP04196 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRGP04196 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HRGP04196 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HRGP04196 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRGP04196 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRGP04196 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRGP04196 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRGP04196 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HRGP04196 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRGP04196 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRGP04196 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRGP04196 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRGP04196 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRGP04196 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HRGP04196 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRGP04196 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HRGP04196 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HRGP04196 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRGP04196 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HRGP04196 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRGP04196 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRGP04196 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HRGP04196 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRGP04196 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HRGP04196 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HRGP04196 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HRGP04196 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HRGP04196 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HRGP04196 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HRGP04196 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HRGP04196 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRGP04196 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HRGP04196 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HRGP04196 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HRGP04196 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRGP04196 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HRGP04196 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HRGP04196 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRGP04196 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HRGP04196 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HRGP04196 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRGP04196 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HRGP04196 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRGP04196 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRGP04196 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HRGP04196 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HRGP04196 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HRGP04196 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRGP04196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HRGP04196 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRGP04196 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HRGP04196 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HRGP04196 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HRGP04196 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRGP04196 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HRGP04196 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HRGP04196 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRGP04196 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRGP04196 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HRGP04196 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRGP04196 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRGP04196 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HRGP04196 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRGP04196 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRGP04196 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HRGP04196 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRGP04196 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRGP04196 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HRGP04196 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRGP04196 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HRGP04196 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRGP04196 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRGP04196 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HRGP04196 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRGP04196 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRGP04196 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HRGP04196 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HRGP04196 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HRGP04196 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HRGP04196 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms