Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C9P02748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C9P02748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
C9P02748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C9P02748 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C9P02748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9P02748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C9P02748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C9P02748 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C9P02748 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9P02748 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C9P02748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9P02748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9P02748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C9P02748 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C9P02748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9P02748 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9P02748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9P02748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C9P02748 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9P02748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C9P02748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
C9P02748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9P02748 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
C9P02748 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9P02748 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9P02748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C9P02748 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9P02748 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9P02748 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C9P02748 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C9P02748 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9P02748 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9P02748 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9P02748 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9P02748 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C9P02748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C9P02748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C9P02748 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
C9P02748 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C9P02748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C9P02748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C9P02748 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9P02748 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9P02748 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C9P02748 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C9P02748 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9P02748 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9P02748 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C9P02748 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9P02748 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9P02748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C9P02748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
C9P02748 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C9P02748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C9P02748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C9P02748 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C9P02748 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9P02748 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9P02748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9P02748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9P02748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9P02748 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C9P02748 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9P02748 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9P02748 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9P02748 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C9P02748 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C9P02748 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C9P02748 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
C9P02748 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
C9P02748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9P02748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9P02748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C9P02748 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9P02748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9P02748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9P02748 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C9P02748 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C9P02748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C9P02748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C9P02748 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C9P02748 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C9P02748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C9P02748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C9P02748 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C9P02748 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C9P02748 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C9P02748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C9P02748 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9P02748 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9P02748 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C9P02748 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9P02748 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C9P02748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C9P02748 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9P02748 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9P02748 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9P02748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C9P02748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms