Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC4A1P02730 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC4A1P02730 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC4A1P02730 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC4A1P02730 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A1P02730 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC4A1P02730 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A1P02730 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC4A1P02730 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC4A1P02730 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms