Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-Ab1P01921 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-Ab1P01921 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-Ab1P01921 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-Ab1P01921 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-Ab1P01921 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-Ab1P01921 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2-Ab1P01921 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2-Ab1P01921 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms