Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
P01734 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
P01734 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
P01734 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
P01734 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
P01734 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
P01734 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
P01734 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
P01734 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
P01734 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
P01734 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
P01734 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
P01734 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
P01734 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
P01734 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P01734 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P01734 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
P01734 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
P01734 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
P01734 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
P01734 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P01734 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P01734 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P01734 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P01734 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P01734 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
P01734 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
P01734 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P01734 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
P01734 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
P01734 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
P01734 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P01734 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P01734 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P01734 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P01734 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P01734 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P01734 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
P01734 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P01734 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
P01734 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P01734 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P01734 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P01734 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
P01734 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
P01734 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P01734 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P01734 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
P01734 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
P01734 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
P01734 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
P01734 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
P01734 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P01734 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P01734 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
P01734 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P01734 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P01734 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P01734 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
P01734 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
P01734 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
P01734 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P01734 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P01734 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P01734 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P01734 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
P01734 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
P01734 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
P01734 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
P01734 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
P01734 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms