Protein–RNA interactions for Protein: P01116

KRAS, GTPase KRas, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRASP01116 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRASP01116 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRASP01116 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRASP01116 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRASP01116 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRASP01116 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRASP01116 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRASP01116 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRASP01116 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRASP01116 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRASP01116 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRASP01116 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRASP01116 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRASP01116 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRASP01116 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRASP01116 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRASP01116 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRASP01116 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRASP01116 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRASP01116 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRASP01116 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRASP01116 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRASP01116 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRASP01116 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRASP01116 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRASP01116 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRASP01116 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRASP01116 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRASP01116 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRASP01116 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRASP01116 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRASP01116 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRASP01116 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRASP01116 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRASP01116 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRASP01116 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRASP01116 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRASP01116 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRASP01116 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRASP01116 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRASP01116 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRASP01116 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRASP01116 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRASP01116 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KRASP01116 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRASP01116 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRASP01116 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRASP01116 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRASP01116 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRASP01116 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KRASP01116 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRASP01116 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRASP01116 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRASP01116 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRASP01116 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRASP01116 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRASP01116 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRASP01116 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRASP01116 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRASP01116 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRASP01116 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRASP01116 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRASP01116 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRASP01116 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRASP01116 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRASP01116 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRASP01116 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRASP01116 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRASP01116 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRASP01116 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRASP01116 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRASP01116 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRASP01116 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRASP01116 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRASP01116 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRASP01116 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRASP01116 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRASP01116 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRASP01116 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRASP01116 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRASP01116 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRASP01116 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRASP01116 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KRASP01116 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRASP01116 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRASP01116 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KRASP01116 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRASP01116 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KRASP01116 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRASP01116 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KRASP01116 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRASP01116 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRASP01116 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KRASP01116 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRASP01116 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRASP01116 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRASP01116 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRASP01116 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRASP01116 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KRASP01116 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms