Protein–RNA interactions for Protein: P00374

DHFR, Dihydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFRP00374 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DHFRP00374 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHFRP00374 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHFRP00374 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHFRP00374 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHFRP00374 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DHFRP00374 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHFRP00374 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHFRP00374 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHFRP00374 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DHFRP00374 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DHFRP00374 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHFRP00374 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHFRP00374 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHFRP00374 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DHFRP00374 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHFRP00374 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DHFRP00374 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHFRP00374 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHFRP00374 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHFRP00374 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHFRP00374 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHFRP00374 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHFRP00374 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHFRP00374 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHFRP00374 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DHFRP00374 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DHFRP00374 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHFRP00374 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DHFRP00374 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHFRP00374 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHFRP00374 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHFRP00374 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DHFRP00374 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHFRP00374 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHFRP00374 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHFRP00374 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHFRP00374 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DHFRP00374 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHFRP00374 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHFRP00374 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DHFRP00374 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHFRP00374 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DHFRP00374 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DHFRP00374 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHFRP00374 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DHFRP00374 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHFRP00374 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHFRP00374 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHFRP00374 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DHFRP00374 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHFRP00374 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHFRP00374 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DHFRP00374 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHFRP00374 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHFRP00374 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHFRP00374 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHFRP00374 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHFRP00374 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DHFRP00374 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DHFRP00374 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DHFRP00374 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHFRP00374 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHFRP00374 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHFRP00374 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHFRP00374 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DHFRP00374 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHFRP00374 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DHFRP00374 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHFRP00374 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DHFRP00374 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DHFRP00374 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DHFRP00374 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DHFRP00374 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DHFRP00374 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHFRP00374 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DHFRP00374 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHFRP00374 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DHFRP00374 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DHFRP00374 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DHFRP00374 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DHFRP00374 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DHFRP00374 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DHFRP00374 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHFRP00374 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHFRP00374 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DHFRP00374 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DHFRP00374 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DHFRP00374 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DHFRP00374 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DHFRP00374 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHFRP00374 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DHFRP00374 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DHFRP00374 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms