Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CHEK2O96017 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHEK2O96017 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHEK2O96017 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHEK2O96017 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHEK2O96017 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHEK2O96017 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHEK2O96017 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHEK2O96017 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms