Protein–RNA interactions for Protein: O96009

NAPSA, Napsin-A, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPSAO96009 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPSAO96009 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPSAO96009 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NAPSAO96009 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NAPSAO96009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAPSAO96009 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAPSAO96009 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAPSAO96009 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAPSAO96009 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms