Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
APBB3O95704 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
APBB3O95704 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBB3O95704 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
APBB3O95704 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBB3O95704 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBB3O95704 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBB3O95704 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
APBB3O95704 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
APBB3O95704 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBB3O95704 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
APBB3O95704 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
APBB3O95704 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBB3O95704 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
APBB3O95704 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
APBB3O95704 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
APBB3O95704 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APBB3O95704 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBB3O95704 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APBB3O95704 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBB3O95704 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APBB3O95704 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APBB3O95704 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
APBB3O95704 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBB3O95704 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APBB3O95704 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APBB3O95704 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APBB3O95704 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APBB3O95704 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APBB3O95704 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APBB3O95704 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
APBB3O95704 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBB3O95704 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBB3O95704 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APBB3O95704 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBB3O95704 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBB3O95704 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBB3O95704 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APBB3O95704 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBB3O95704 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APBB3O95704 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBB3O95704 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBB3O95704 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APBB3O95704 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APBB3O95704 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBB3O95704 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBB3O95704 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APBB3O95704 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APBB3O95704 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBB3O95704 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APBB3O95704 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APBB3O95704 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBB3O95704 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APBB3O95704 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBB3O95704 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APBB3O95704 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APBB3O95704 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBB3O95704 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBB3O95704 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APBB3O95704 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APBB3O95704 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APBB3O95704 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APBB3O95704 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APBB3O95704 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APBB3O95704 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBB3O95704 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBB3O95704 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
APBB3O95704 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBB3O95704 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APBB3O95704 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
APBB3O95704 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
APBB3O95704 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
APBB3O95704 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBB3O95704 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBB3O95704 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APBB3O95704 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBB3O95704 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBB3O95704 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APBB3O95704 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APBB3O95704 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
APBB3O95704 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBB3O95704 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBB3O95704 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBB3O95704 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBB3O95704 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APBB3O95704 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
APBB3O95704 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
APBB3O95704 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APBB3O95704 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBB3O95704 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBB3O95704 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
APBB3O95704 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
APBB3O95704 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
APBB3O95704 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBB3O95704 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APBB3O95704 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBB3O95704 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APBB3O95704 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBB3O95704 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
APBB3O95704 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms