Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLDN7O95471 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLDN7O95471 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLDN7O95471 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLDN7O95471 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CLDN7O95471 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLDN7O95471 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLDN7O95471 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLDN7O95471 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms