Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB6O95452 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB6O95452 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB6O95452 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB6O95452 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB6O95452 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB6O95452 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB6O95452 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB6O95452 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB6O95452 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB6O95452 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB6O95452 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB6O95452 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB6O95452 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJB6O95452 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB6O95452 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB6O95452 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJB6O95452 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJB6O95452 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB6O95452 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJB6O95452 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB6O95452 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB6O95452 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GJB6O95452 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJB6O95452 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB6O95452 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJB6O95452 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB6O95452 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB6O95452 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJB6O95452 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB6O95452 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB6O95452 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJB6O95452 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJB6O95452 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJB6O95452 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB6O95452 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GJB6O95452 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJB6O95452 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB6O95452 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB6O95452 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB6O95452 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB6O95452 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB6O95452 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB6O95452 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB6O95452 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB6O95452 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB6O95452 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB6O95452 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB6O95452 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB6O95452 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB6O95452 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB6O95452 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB6O95452 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB6O95452 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB6O95452 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GJB6O95452 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB6O95452 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB6O95452 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB6O95452 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB6O95452 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB6O95452 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB6O95452 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB6O95452 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB6O95452 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB6O95452 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB6O95452 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB6O95452 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB6O95452 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB6O95452 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB6O95452 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB6O95452 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB6O95452 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB6O95452 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB6O95452 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB6O95452 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB6O95452 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB6O95452 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB6O95452 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB6O95452 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJB6O95452 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB6O95452 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB6O95452 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
GJB6O95452 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB6O95452 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJB6O95452 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB6O95452 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GJB6O95452 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJB6O95452 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB6O95452 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJB6O95452 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB6O95452 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJB6O95452 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB6O95452 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB6O95452 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB6O95452 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GJB6O95452 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB6O95452 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB6O95452 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB6O95452 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GJB6O95452 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms