Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJB5O95377 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJB5O95377 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJB5O95377 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB5O95377 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB5O95377 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB5O95377 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJB5O95377 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJB5O95377 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJB5O95377 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GJB5O95377 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB5O95377 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB5O95377 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GJB5O95377 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB5O95377 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJB5O95377 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJB5O95377 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GJB5O95377 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJB5O95377 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB5O95377 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB5O95377 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJB5O95377 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB5O95377 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJB5O95377 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB5O95377 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJB5O95377 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJB5O95377 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB5O95377 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GJB5O95377 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB5O95377 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB5O95377 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB5O95377 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJB5O95377 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB5O95377 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB5O95377 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB5O95377 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJB5O95377 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB5O95377 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GJB5O95377 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB5O95377 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJB5O95377 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GJB5O95377 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJB5O95377 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB5O95377 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJB5O95377 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB5O95377 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJB5O95377 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJB5O95377 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB5O95377 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJB5O95377 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB5O95377 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB5O95377 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GJB5O95377 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB5O95377 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB5O95377 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB5O95377 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJB5O95377 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJB5O95377 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJB5O95377 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB5O95377 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJB5O95377 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJB5O95377 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB5O95377 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB5O95377 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB5O95377 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB5O95377 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJB5O95377 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJB5O95377 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GJB5O95377 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB5O95377 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GJB5O95377 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJB5O95377 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJB5O95377 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJB5O95377 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB5O95377 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJB5O95377 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB5O95377 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJB5O95377 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJB5O95377 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GJB5O95377 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GJB5O95377 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB5O95377 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJB5O95377 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB5O95377 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB5O95377 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB5O95377 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB5O95377 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJB5O95377 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GJB5O95377 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB5O95377 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB5O95377 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB5O95377 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJB5O95377 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB5O95377 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJB5O95377 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB5O95377 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB5O95377 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB5O95377 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB5O95377 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJB5O95377 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms