Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCAF4O95104 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAF4O95104 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCAF4O95104 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCAF4O95104 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCAF4O95104 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAF4O95104 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAF4O95104 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAF4O95104 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms