Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrc6O88978 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrc6O88978 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc6O88978 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc6O88978 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc6O88978 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc6O88978 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc6O88978 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc6O88978 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc6O88978 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc6O88978 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc6O88978 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc6O88978 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc6O88978 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc6O88978 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc6O88978 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc6O88978 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc6O88978 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc6O88978 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms