Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc6a20bO88575 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Slc6a20bO88575 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Slc6a20bO88575 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Slc6a20bO88575 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slc6a20bO88575 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slc6a20bO88575 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc6a20bO88575 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slc6a20bO88575 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slc6a20bO88575 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Slc6a20bO88575 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Slc6a20bO88575 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc6a20bO88575 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Slc6a20bO88575 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc6a20bO88575 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc6a20bO88575 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Slc6a20bO88575 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc6a20bO88575 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc6a20bO88575 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc6a20bO88575 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc6a20bO88575 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc6a20bO88575 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slc6a20bO88575 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc6a20bO88575 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slc6a20bO88575 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Slc6a20bO88575 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Slc6a20bO88575 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Slc6a20bO88575 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc6a20bO88575 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Slc6a20bO88575 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms