Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Znf106O88466 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Znf106O88466 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Znf106O88466 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Znf106O88466 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf106O88466 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Znf106O88466 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Znf106O88466 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf106O88466 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Znf106O88466 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf106O88466 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf106O88466 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Znf106O88466 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf106O88466 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Znf106O88466 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Znf106O88466 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Znf106O88466 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Znf106O88466 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf106O88466 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Znf106O88466 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf106O88466 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf106O88466 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf106O88466 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf106O88466 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Znf106O88466 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf106O88466 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Znf106O88466 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Znf106O88466 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf106O88466 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Znf106O88466 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms