Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nid2O88322 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Nid2O88322 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Nid2O88322 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nid2O88322 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nid2O88322 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Nid2O88322 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Nid2O88322 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Nid2O88322 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nid2O88322 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nid2O88322 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Nid2O88322 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Nid2O88322 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Nid2O88322 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nid2O88322 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nid2O88322 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Nid2O88322 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nid2O88322 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Nid2O88322 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nid2O88322 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Nid2O88322 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nid2O88322 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nid2O88322 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Nid2O88322 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nid2O88322 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nid2O88322 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Nid2O88322 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nid2O88322 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nid2O88322 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nid2O88322 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Nid2O88322 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Nid2O88322 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Nid2O88322 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nid2O88322 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nid2O88322 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nid2O88322 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Nid2O88322 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nid2O88322 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Nid2O88322 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Nid2O88322 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Nid2O88322 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Nid2O88322 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Nid2O88322 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nid2O88322 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nid2O88322 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nid2O88322 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nid2O88322 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nid2O88322 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Nid2O88322 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Nid2O88322 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nid2O88322 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nid2O88322 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Nid2O88322 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nid2O88322 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nid2O88322 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Nid2O88322 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nid2O88322 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Nid2O88322 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nid2O88322 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Nid2O88322 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Nid2O88322 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Nid2O88322 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Nid2O88322 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Nid2O88322 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Nid2O88322 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms