Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clec11aO88200 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clec11aO88200 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clec11aO88200 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clec11aO88200 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clec11aO88200 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clec11aO88200 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Clec11aO88200 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clec11aO88200 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clec11aO88200 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clec11aO88200 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clec11aO88200 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clec11aO88200 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clec11aO88200 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clec11aO88200 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Clec11aO88200 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Clec11aO88200 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Clec11aO88200 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Clec11aO88200 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Clec11aO88200 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Clec11aO88200 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Clec11aO88200 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms