Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DCTN3O75935 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DCTN3O75935 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DCTN3O75935 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCTN3O75935 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCTN3O75935 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCTN3O75935 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCTN3O75935 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCTN3O75935 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCTN3O75935 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCTN3O75935 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCTN3O75935 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCTN3O75935 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCTN3O75935 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms