Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB3O75712 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB3O75712 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB3O75712 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB3O75712 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB3O75712 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB3O75712 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB3O75712 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB3O75712 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB3O75712 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB3O75712 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB3O75712 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB3O75712 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB3O75712 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GJB3O75712 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB3O75712 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB3O75712 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB3O75712 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GJB3O75712 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB3O75712 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB3O75712 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GJB3O75712 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB3O75712 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GJB3O75712 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB3O75712 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GJB3O75712 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GJB3O75712 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB3O75712 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB3O75712 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GJB3O75712 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB3O75712 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GJB3O75712 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB3O75712 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GJB3O75712 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB3O75712 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB3O75712 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GJB3O75712 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GJB3O75712 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GJB3O75712 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GJB3O75712 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB3O75712 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GJB3O75712 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB3O75712 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJB3O75712 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB3O75712 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJB3O75712 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GJB3O75712 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJB3O75712 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJB3O75712 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB3O75712 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GJB3O75712 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJB3O75712 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GJB3O75712 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB3O75712 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJB3O75712 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB3O75712 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GJB3O75712 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
GJB3O75712 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB3O75712 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB3O75712 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB3O75712 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GJB3O75712 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJB3O75712 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB3O75712 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB3O75712 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB3O75712 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB3O75712 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB3O75712 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJB3O75712 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB3O75712 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB3O75712 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GJB3O75712 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB3O75712 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJB3O75712 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB3O75712 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB3O75712 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJB3O75712 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GJB3O75712 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJB3O75712 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GJB3O75712 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GJB3O75712 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB3O75712 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GJB3O75712 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB3O75712 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB3O75712 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB3O75712 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB3O75712 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GJB3O75712 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GJB3O75712 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB3O75712 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GJB3O75712 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB3O75712 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB3O75712 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GJB3O75712 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GJB3O75712 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB3O75712 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GJB3O75712 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GJB3O75712 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GJB3O75712 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB3O75712 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms