Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA10O75578 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA10O75578 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA10O75578 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ITGA10O75578 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ITGA10O75578 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA10O75578 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA10O75578 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITGA10O75578 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms