Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN5O75503 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN5O75503 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN5O75503 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN5O75503 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN5O75503 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN5O75503 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN5O75503 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN5O75503 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN5O75503 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN5O75503 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN5O75503 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN5O75503 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN5O75503 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN5O75503 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN5O75503 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN5O75503 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN5O75503 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN5O75503 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN5O75503 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLN5O75503 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN5O75503 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN5O75503 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN5O75503 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN5O75503 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN5O75503 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN5O75503 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN5O75503 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN5O75503 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN5O75503 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN5O75503 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN5O75503 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN5O75503 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN5O75503 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN5O75503 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN5O75503 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLN5O75503 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLN5O75503 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN5O75503 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN5O75503 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN5O75503 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN5O75503 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN5O75503 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN5O75503 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN5O75503 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLN5O75503 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLN5O75503 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN5O75503 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN5O75503 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN5O75503 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLN5O75503 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLN5O75503 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN5O75503 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN5O75503 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN5O75503 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN5O75503 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLN5O75503 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLN5O75503 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLN5O75503 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN5O75503 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN5O75503 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN5O75503 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN5O75503 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLN5O75503 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN5O75503 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN5O75503 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLN5O75503 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN5O75503 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CLN5O75503 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN5O75503 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN5O75503 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CLN5O75503 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN5O75503 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN5O75503 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN5O75503 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN5O75503 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN5O75503 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CLN5O75503 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLN5O75503 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLN5O75503 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN5O75503 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN5O75503 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN5O75503 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLN5O75503 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN5O75503 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN5O75503 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLN5O75503 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN5O75503 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN5O75503 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN5O75503 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN5O75503 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLN5O75503 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLN5O75503 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms