Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GPC4O75487 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC4O75487 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GPC4O75487 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC4O75487 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GPC4O75487 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC4O75487 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GPC4O75487 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC4O75487 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC4O75487 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC4O75487 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC4O75487 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GPC4O75487 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC4O75487 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC4O75487 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GPC4O75487 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC4O75487 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC4O75487 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC4O75487 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GPC4O75487 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPC4O75487 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPC4O75487 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC4O75487 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC4O75487 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPC4O75487 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC4O75487 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC4O75487 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC4O75487 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC4O75487 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC4O75487 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC4O75487 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC4O75487 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC4O75487 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC4O75487 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC4O75487 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC4O75487 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC4O75487 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC4O75487 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC4O75487 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC4O75487 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC4O75487 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC4O75487 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPC4O75487 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPC4O75487 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC4O75487 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPC4O75487 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC4O75487 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPC4O75487 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC4O75487 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPC4O75487 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC4O75487 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC4O75487 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPC4O75487 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC4O75487 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC4O75487 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC4O75487 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC4O75487 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC4O75487 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC4O75487 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC4O75487 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC4O75487 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC4O75487 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC4O75487 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC4O75487 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC4O75487 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC4O75487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC4O75487 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC4O75487 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC4O75487 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC4O75487 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC4O75487 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC4O75487 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC4O75487 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC4O75487 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC4O75487 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC4O75487 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC4O75487 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC4O75487 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC4O75487 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC4O75487 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC4O75487 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC4O75487 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC4O75487 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPC4O75487 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC4O75487 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPC4O75487 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC4O75487 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC4O75487 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPC4O75487 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC4O75487 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPC4O75487 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC4O75487 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPC4O75487 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPC4O75487 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC4O75487 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPC4O75487 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC4O75487 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC4O75487 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC4O75487 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GPC4O75487 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms