Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP12O75317 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP12O75317 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP12O75317 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP12O75317 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP12O75317 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP12O75317 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP12O75317 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP12O75317 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP12O75317 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP12O75317 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP12O75317 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP12O75317 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP12O75317 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP12O75317 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP12O75317 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP12O75317 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP12O75317 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP12O75317 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP12O75317 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP12O75317 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP12O75317 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP12O75317 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP12O75317 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP12O75317 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
USP12O75317 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP12O75317 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP12O75317 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP12O75317 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP12O75317 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP12O75317 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP12O75317 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP12O75317 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP12O75317 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP12O75317 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP12O75317 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP12O75317 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP12O75317 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP12O75317 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP12O75317 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP12O75317 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP12O75317 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP12O75317 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP12O75317 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP12O75317 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP12O75317 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP12O75317 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP12O75317 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP12O75317 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP12O75317 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP12O75317 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP12O75317 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP12O75317 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP12O75317 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP12O75317 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP12O75317 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP12O75317 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP12O75317 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP12O75317 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP12O75317 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP12O75317 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP12O75317 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP12O75317 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP12O75317 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP12O75317 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP12O75317 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP12O75317 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP12O75317 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP12O75317 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP12O75317 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP12O75317 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP12O75317 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP12O75317 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP12O75317 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP12O75317 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP12O75317 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP12O75317 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USP12O75317 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP12O75317 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USP12O75317 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP12O75317 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP12O75317 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP12O75317 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP12O75317 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP12O75317 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP12O75317 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP12O75317 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP12O75317 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP12O75317 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP12O75317 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP12O75317 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP12O75317 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP12O75317 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP12O75317 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP12O75317 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP12O75317 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP12O75317 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP12O75317 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP12O75317 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP12O75317 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms