Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH16O75309 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH16O75309 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH16O75309 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CDH16O75309 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH16O75309 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH16O75309 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH16O75309 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH16O75309 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH16O75309 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH16O75309 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH16O75309 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH16O75309 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH16O75309 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDH16O75309 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH16O75309 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH16O75309 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH16O75309 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH16O75309 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH16O75309 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH16O75309 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH16O75309 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH16O75309 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH16O75309 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH16O75309 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH16O75309 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH16O75309 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH16O75309 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH16O75309 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH16O75309 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH16O75309 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH16O75309 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH16O75309 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH16O75309 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH16O75309 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH16O75309 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH16O75309 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH16O75309 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH16O75309 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH16O75309 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH16O75309 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH16O75309 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH16O75309 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH16O75309 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH16O75309 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH16O75309 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH16O75309 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH16O75309 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH16O75309 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDH16O75309 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDH16O75309 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH16O75309 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH16O75309 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH16O75309 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH16O75309 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH16O75309 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH16O75309 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH16O75309 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH16O75309 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH16O75309 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH16O75309 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH16O75309 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH16O75309 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH16O75309 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH16O75309 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH16O75309 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH16O75309 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH16O75309 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH16O75309 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH16O75309 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH16O75309 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH16O75309 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH16O75309 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH16O75309 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH16O75309 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH16O75309 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH16O75309 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH16O75309 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH16O75309 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH16O75309 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH16O75309 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH16O75309 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH16O75309 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH16O75309 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH16O75309 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH16O75309 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH16O75309 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH16O75309 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH16O75309 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH16O75309 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH16O75309 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH16O75309 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH16O75309 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH16O75309 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDH16O75309 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH16O75309 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDH16O75309 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH16O75309 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH16O75309 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDH16O75309 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms