Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SIN3BO75182 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIN3BO75182 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SIN3BO75182 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIN3BO75182 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SIN3BO75182 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SIN3BO75182 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3BO75182 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3BO75182 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3BO75182 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SIN3BO75182 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3BO75182 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SIN3BO75182 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIN3BO75182 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIN3BO75182 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIN3BO75182 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIN3BO75182 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3BO75182 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIN3BO75182 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIN3BO75182 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SIN3BO75182 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIN3BO75182 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms