Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF3O75054 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IGSF3O75054 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
IGSF3O75054 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
IGSF3O75054 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
IGSF3O75054 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
IGSF3O75054 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
IGSF3O75054 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
IGSF3O75054 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IGSF3O75054 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
IGSF3O75054 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
IGSF3O75054 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
IGSF3O75054 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms