Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM1O60565 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GREM1O60565 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM1O60565 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM1O60565 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM1O60565 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GREM1O60565 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GREM1O60565 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM1O60565 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM1O60565 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GREM1O60565 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM1O60565 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM1O60565 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM1O60565 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GREM1O60565 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GREM1O60565 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GREM1O60565 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GREM1O60565 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GREM1O60565 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GREM1O60565 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREM1O60565 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREM1O60565 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GREM1O60565 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GREM1O60565 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREM1O60565 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREM1O60565 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GREM1O60565 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREM1O60565 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GREM1O60565 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GREM1O60565 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GREM1O60565 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GREM1O60565 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GREM1O60565 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GREM1O60565 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GREM1O60565 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GREM1O60565 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GREM1O60565 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GREM1O60565 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GREM1O60565 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GREM1O60565 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GREM1O60565 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GREM1O60565 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GREM1O60565 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GREM1O60565 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GREM1O60565 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GREM1O60565 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GREM1O60565 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GREM1O60565 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREM1O60565 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREM1O60565 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREM1O60565 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREM1O60565 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GREM1O60565 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GREM1O60565 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GREM1O60565 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GREM1O60565 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GREM1O60565 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GREM1O60565 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GREM1O60565 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GREM1O60565 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GREM1O60565 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GREM1O60565 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GREM1O60565 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GREM1O60565 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GREM1O60565 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREM1O60565 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREM1O60565 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GREM1O60565 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GREM1O60565 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GREM1O60565 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GREM1O60565 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GREM1O60565 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GREM1O60565 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREM1O60565 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GREM1O60565 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GREM1O60565 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GREM1O60565 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GREM1O60565 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GREM1O60565 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GREM1O60565 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GREM1O60565 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GREM1O60565 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GREM1O60565 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GREM1O60565 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GREM1O60565 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GREM1O60565 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GREM1O60565 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GREM1O60565 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GREM1O60565 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GREM1O60565 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GREM1O60565 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GREM1O60565 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GREM1O60565 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GREM1O60565 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GREM1O60565 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GREM1O60565 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GREM1O60565 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GREM1O60565 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GREM1O60565 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GREM1O60565 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms