Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IlkO55222 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IlkO55222 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IlkO55222 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IlkO55222 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IlkO55222 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IlkO55222 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IlkO55222 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IlkO55222 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IlkO55222 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IlkO55222 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IlkO55222 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkO55222 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkO55222 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkO55222 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkO55222 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkO55222 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IlkO55222 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IlkO55222 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IlkO55222 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IlkO55222 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IlkO55222 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IlkO55222 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IlkO55222 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IlkO55222 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IlkO55222 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
IlkO55222 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IlkO55222 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IlkO55222 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IlkO55222 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IlkO55222 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IlkO55222 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
IlkO55222 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IlkO55222 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IlkO55222 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IlkO55222 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IlkO55222 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IlkO55222 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IlkO55222 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
IlkO55222 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IlkO55222 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IlkO55222 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IlkO55222 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IlkO55222 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IlkO55222 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IlkO55222 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IlkO55222 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IlkO55222 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IlkO55222 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IlkO55222 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IlkO55222 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IlkO55222 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IlkO55222 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IlkO55222 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IlkO55222 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IlkO55222 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IlkO55222 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IlkO55222 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IlkO55222 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IlkO55222 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IlkO55222 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IlkO55222 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IlkO55222 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IlkO55222 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IlkO55222 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IlkO55222 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IlkO55222 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IlkO55222 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IlkO55222 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IlkO55222 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IlkO55222 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IlkO55222 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IlkO55222 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IlkO55222 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IlkO55222 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IlkO55222 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IlkO55222 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IlkO55222 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IlkO55222 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IlkO55222 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IlkO55222 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IlkO55222 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IlkO55222 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IlkO55222 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IlkO55222 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IlkO55222 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IlkO55222 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IlkO55222 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IlkO55222 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IlkO55222 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IlkO55222 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IlkO55222 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IlkO55222 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IlkO55222 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IlkO55222 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IlkO55222 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IlkO55222 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IlkO55222 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IlkO55222 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IlkO55222 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms