Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr2O55101 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr2O55101 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr2O55101 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syngr2O55101 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syngr2O55101 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syngr2O55101 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syngr2O55101 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Syngr2O55101 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syngr2O55101 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syngr2O55101 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngr2O55101 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Syngr2O55101 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Syngr2O55101 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms