Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Copb2O55029 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Copb2O55029 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Copb2O55029 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Copb2O55029 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Copb2O55029 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Copb2O55029 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Copb2O55029 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Copb2O55029 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Copb2O55029 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Copb2O55029 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Copb2O55029 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Copb2O55029 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Copb2O55029 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Copb2O55029 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Copb2O55029 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Copb2O55029 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Copb2O55029 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Copb2O55029 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Copb2O55029 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Copb2O55029 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Copb2O55029 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Copb2O55029 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Copb2O55029 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Copb2O55029 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Copb2O55029 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Copb2O55029 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Copb2O55029 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Copb2O55029 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Copb2O55029 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Copb2O55029 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Copb2O55029 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Copb2O55029 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Copb2O55029 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Copb2O55029 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Copb2O55029 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Copb2O55029 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Copb2O55029 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Copb2O55029 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Copb2O55029 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Copb2O55029 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms