Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NlkO54949 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NlkO54949 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NlkO54949 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NlkO54949 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NlkO54949 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NlkO54949 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NlkO54949 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NlkO54949 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NlkO54949 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NlkO54949 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NlkO54949 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NlkO54949 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NlkO54949 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NlkO54949 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NlkO54949 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NlkO54949 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NlkO54949 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NlkO54949 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NlkO54949 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NlkO54949 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NlkO54949 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NlkO54949 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NlkO54949 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NlkO54949 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NlkO54949 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NlkO54949 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NlkO54949 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NlkO54949 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NlkO54949 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NlkO54949 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NlkO54949 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NlkO54949 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NlkO54949 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NlkO54949 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NlkO54949 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NlkO54949 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NlkO54949 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NlkO54949 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NlkO54949 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NlkO54949 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NlkO54949 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NlkO54949 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NlkO54949 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NlkO54949 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NlkO54949 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NlkO54949 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NlkO54949 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NlkO54949 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NlkO54949 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NlkO54949 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NlkO54949 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NlkO54949 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NlkO54949 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NlkO54949 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NlkO54949 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NlkO54949 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NlkO54949 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NlkO54949 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NlkO54949 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NlkO54949 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NlkO54949 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NlkO54949 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NlkO54949 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NlkO54949 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NlkO54949 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NlkO54949 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NlkO54949 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NlkO54949 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NlkO54949 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NlkO54949 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NlkO54949 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NlkO54949 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NlkO54949 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NlkO54949 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NlkO54949 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NlkO54949 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NlkO54949 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NlkO54949 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NlkO54949 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NlkO54949 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NlkO54949 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NlkO54949 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NlkO54949 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NlkO54949 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NlkO54949 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NlkO54949 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NlkO54949 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NlkO54949 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NlkO54949 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NlkO54949 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NlkO54949 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NlkO54949 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NlkO54949 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NlkO54949 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NlkO54949 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NlkO54949 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NlkO54949 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NlkO54949 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NlkO54949 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms